Behandlingsforløbet afhænger hvilken form for kræft der skal behandles og behandlingsprotokollen. De fleste protokoller kræver mellem 3 og 12 behandlinger, foruden en række kontrolbesøg. Ved kontrolbesøgene vil der ofte blive udtaget blod- og/eller urinprøver og muligvis andre undersøgelser. Selve kemoterapien foregår ambulant og gives enten som piller, i et drop ind i en blodåre eller som indsprøjtning i musklen.